Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gbf1Q6DFZ1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms