Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PtprdQ64487 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms