Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc18Q640L5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc18Q640L5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc18Q640L5 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Ccdc18Q640L5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc18Q640L5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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