Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sall3Q62255 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sall3Q62255 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms