Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ecm2Q5FW85 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ecm2Q5FW85 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms