Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ulk4Q3V129 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ulk4Q3V129 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms