Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Usp30Q3UN04 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp30Q3UN04 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms