Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Puf60Q3UEB3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Puf60Q3UEB3 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
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