Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Cops9Q3U898 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Cops9Q3U898 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms