Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ulk3Q3U3Q1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ulk3Q3U3Q1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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