Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q3U1D9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Q3U1D9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Q3U1D9 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Q3U1D9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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