Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Hbq1bQ3U0A6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms