Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms