Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf2f1Q3THK3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms