Protein–RNA interactions for Protein: Q17ST2

Kcna7, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 7, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna7Q17ST2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Kcna7Q17ST2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Kcna7Q17ST2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.7 ms