Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Cib3Q0P523 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cib3Q0P523 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms