Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc21bQ0HA38 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc21bQ0HA38 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc21bQ0HA38 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc21bQ0HA38 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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Ttc21bQ0HA38 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Ttc21bQ0HA38 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ttc21bQ0HA38 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ttc21bQ0HA38 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms