Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Apoc2Q05020 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Apoc2Q05020 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms