Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scg2Q03517 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms