Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Mc1rQ01727 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mc1rQ01727 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms