Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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Irx1P81068 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Irx1P81068 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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