Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Usp9xP70398 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms