Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tspan5P62080 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tspan5P62080 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms