Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tpm2P58774 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms