Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn18P56857 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn18P56857 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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