Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bace1P56818 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Bace1P56818 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms