Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sh3bp1P55194 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Sh3bp1P55194 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sh3bp1P55194 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sh3bp1P55194 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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