Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Aqp4P55088 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Aqp4P55088 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Aqp4P55088 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Aqp4P55088 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Aqp4P55088 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Aqp4P55088 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Aqp4P55088 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Aqp4P55088 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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