Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Cdkn1bP46414 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms