Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sept1P42209 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sept1P42209 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sept1P42209 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sept1P42209 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sept1P42209 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sept1P42209 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sept1P42209 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms