Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Hoxd8P23463 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hoxd8P23463 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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