Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Hoxd4P10628 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms