Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm26609-201ENSMUST00000181302 852 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm18382-201ENSMUST00000194394 582 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Hoxb4P10284 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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