Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PdgfrbP05622 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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