Protein–RNA interactions for Protein: O88796

Rpp30, Ribonuclease P protein subunit p30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp30O88796 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpp30O88796 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpp30O88796 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpp30O88796 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpp30O88796 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpp30O88796 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rpp30O88796 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Rpp30O88796 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rpp30O88796 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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