Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Gm20877J3QPZ4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm20877J3QPZ4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms