Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Vmn1r58G3X9U3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms