Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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Defa35E9QLQ1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Defa35E9QLQ1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
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