Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Gm20518E9Q548 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm20518E9Q548 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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