Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Fam43bA2AM80 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms