Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
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