Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stk39Q9Z1W9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stk39Q9Z1W9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms