Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Nme3Q9WV85 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms