Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Col4a3Q9QZS0 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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Col4a3Q9QZS0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Col4a3Q9QZS0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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