Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Tnfrsf23Q9ER63 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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