Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Tspan4Q9DCK3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Tspan4Q9DCK3 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Tspan4Q9DCK3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tspan4Q9DCK3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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