Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc89Q9DA73 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc89Q9DA73 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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