Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms