Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rprd1bQ9CSU0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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