Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Nicn1Q9CQM0 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Nicn1Q9CQM0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.9 ms